MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 1435 chromosome

Total Repeats: 109595

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012943	GCC	2	6	63742	63747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796974
1502	NC_012943	TCG	2	6	63769	63774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796974
1503	NC_012943	GAC	2	6	63816	63821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796974
1504	NC_012943	GCC	2	6	63835	63840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796974
1505	NC_012943	GCC	2	6	63843	63848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796974
1506	NC_012943	GT	3	6	63894	63899	0 %	50 %	50 %	0 %	253796974
1507	NC_012943	TCA	2	6	63970	63975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253796974
1508	NC_012943	TAC	2	6	63987	63992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253796974
1509	NC_012943	AAGG	2	8	63994	64001	50 %	0 %	50 %	0 %	253796974
1510	NC_012943	AGG	3	9	63999	64007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_012943	CCT	2	6	64035	64040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253796975
1512	NC_012943	CGC	2	6	64120	64125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796975
1513	NC_012943	TCG	3	9	64193	64201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796975
1514	NC_012943	CAT	2	6	64230	64235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253796975
1515	NC_012943	CCA	2	6	64244	64249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796975
1516	NC_012943	CAG	2	6	64420	64425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796975
1517	NC_012943	C	6	6	64452	64457	0 %	0 %	0 %	100 %	253796975
1518	NC_012943	GC	3	6	64512	64517	0 %	0 %	50 %	50 %	253796975
1519	NC_012943	GCG	2	6	64536	64541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796975
1520	NC_012943	CAG	2	6	64549	64554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796975
1521	NC_012943	CGC	2	6	64555	64560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796975
1522	NC_012943	CCGATC	2	12	64637	64648	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	253796975
1523	NC_012943	AACC	2	8	64771	64778	50 %	0 %	0 %	50 %	253796975
1524	NC_012943	ACT	2	6	64789	64794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253796975
1525	NC_012943	GCT	2	6	64914	64919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796975
1526	NC_012943	CGA	2	6	65022	65027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796975
1527	NC_012943	TCG	2	6	65082	65087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_012943	GCT	2	6	65129	65134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796976
1529	NC_012943	CGGA	2	8	65135	65142	25 %	0 %	50 %	25 %	253796976
1530	NC_012943	ACC	2	6	65157	65162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796976
1531	NC_012943	GGC	2	6	65167	65172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796976
1532	NC_012943	CCG	2	6	65191	65196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796976
1533	NC_012943	ACTTCA	2	12	65441	65452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253796976
1534	NC_012943	CGG	2	6	65483	65488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796976
1535	NC_012943	TGCCG	2	10	65584	65593	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1536	NC_012943	GCC	2	6	65636	65641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1537	NC_012943	GTC	2	6	65734	65739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796977
1538	NC_012943	ATT	2	6	65767	65772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253796977
1539	NC_012943	TCA	2	6	65787	65792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253796977
1540	NC_012943	CG	3	6	65807	65812	0 %	0 %	50 %	50 %	253796977
1541	NC_012943	CCT	2	6	65825	65830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253796977
1542	NC_012943	CGG	2	6	65959	65964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796977
1543	NC_012943	CGC	2	6	65972	65977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796977
1544	NC_012943	GC	3	6	65976	65981	0 %	0 %	50 %	50 %	253796977
1545	NC_012943	CCG	2	6	65991	65996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796977
1546	NC_012943	CCG	2	6	66057	66062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796977
1547	NC_012943	CGG	2	6	66071	66076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796977
1548	NC_012943	GCG	2	6	66099	66104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796977
1549	NC_012943	GGC	2	6	66107	66112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796977
1550	NC_012943	CGA	2	6	66250	66255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796977
1551	NC_012943	TCG	2	6	66259	66264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796977
1552	NC_012943	GCTG	2	8	66400	66407	0 %	25 %	50 %	25 %	253796977
1553	NC_012943	GCC	2	6	66423	66428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796977
1554	NC_012943	CG	5	10	66453	66462	0 %	0 %	50 %	50 %	253796977
1555	NC_012943	ACC	2	6	66492	66497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796977
1556	NC_012943	GGCGA	2	10	66516	66525	20 %	0 %	60 %	20 %	253796977
1557	NC_012943	CAC	2	6	66647	66652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796977
1558	NC_012943	GC	3	6	66664	66669	0 %	0 %	50 %	50 %	253796977
1559	NC_012943	CGGA	2	8	66709	66716	25 %	0 %	50 %	25 %	253796977
1560	NC_012943	CGTCGG	2	12	66839	66850	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_012943	GGT	2	6	66924	66929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_012943	TGC	2	6	66962	66967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_012943	GCC	2	6	67065	67070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796978
1564	NC_012943	GCC	2	6	67080	67085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796978
1565	NC_012943	CTGG	2	8	67132	67139	0 %	25 %	50 %	25 %	253796978
1566	NC_012943	TTC	2	6	67148	67153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253796978
1567	NC_012943	GAC	2	6	67182	67187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796978
1568	NC_012943	CGG	2	6	67246	67251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796978
1569	NC_012943	AAC	2	6	67311	67316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253796978
1570	NC_012943	ACG	2	6	67420	67425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796978
1571	NC_012943	CCA	2	6	67426	67431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796978
1572	NC_012943	CGGG	2	8	67433	67440	0 %	0 %	75 %	25 %	253796978
1573	NC_012943	CGCC	2	8	67450	67457	0 %	0 %	25 %	75 %	253796978
1574	NC_012943	CGGC	2	8	67492	67499	0 %	0 %	50 %	50 %	253796978
1575	NC_012943	CGGT	2	8	67528	67535	0 %	25 %	50 %	25 %	253796978
1576	NC_012943	GCG	2	6	67555	67560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796978
1577	NC_012943	CGTCGG	2	12	67609	67620	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	253796978
1578	NC_012943	TGC	2	6	67624	67629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796978
1579	NC_012943	ACC	2	6	67663	67668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796978
1580	NC_012943	GCGGTG	2	12	67690	67701	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	253796978
1581	NC_012943	CGT	2	6	67763	67768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796978
1582	NC_012943	CCG	2	6	67834	67839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796978
1583	NC_012943	CCGG	2	8	67914	67921	0 %	0 %	50 %	50 %	253796978
1584	NC_012943	GGC	2	6	67926	67931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796978
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1586	NC_012943	ACCG	2	8	67970	67977	25 %	0 %	25 %	50 %	253796978
1587	NC_012943	CGC	2	6	68047	68052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796978
1588	NC_012943	CGG	2	6	68063	68068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796978
1589	NC_012943	ACG	2	6	68082	68087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796978
1590	NC_012943	CGG	2	6	68119	68124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796978
1591	NC_012943	GC	3	6	68182	68187	0 %	0 %	50 %	50 %	253796978
1592	NC_012943	GGC	2	6	68334	68339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796978
1593	NC_012943	CCG	2	6	68367	68372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796978
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1595	NC_012943	CTG	2	6	68569	68574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796979
1596	NC_012943	CTG	2	6	68588	68593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796979
1597	NC_012943	GCC	3	9	68612	68620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796979
1598	NC_012943	GCC	2	6	68635	68640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796979
1599	NC_012943	TCG	2	6	68688	68693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_012943	AGG	2	6	68712	68717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_012943	CTG	2	6	68774	68779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796980
1602	NC_012943	GGCA	2	8	68785	68792	25 %	0 %	50 %	25 %	253796980
1603	NC_012943	TGC	2	6	68808	68813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796980
1604	NC_012943	CTG	2	6	68897	68902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796980
1605	NC_012943	TGG	2	6	68937	68942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796980
1606	NC_012943	TGCT	2	8	68952	68959	0 %	50 %	25 %	25 %	253796980
1607	NC_012943	CTG	2	6	68966	68971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796980
1608	NC_012943	TCGC	2	8	68977	68984	0 %	25 %	25 %	50 %	253796980
1609	NC_012943	CGA	2	6	69001	69006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796980
1610	NC_012943	GCCG	2	8	69051	69058	0 %	0 %	50 %	50 %	253796980
1611	NC_012943	GGTGT	2	10	69092	69101	0 %	40 %	60 %	0 %	253796980
1612	NC_012943	TTCG	2	8	69115	69122	0 %	50 %	25 %	25 %	253796980
1613	NC_012943	GTT	2	6	69139	69144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253796980
1614	NC_012943	CGGT	2	8	69227	69234	0 %	25 %	50 %	25 %	253796980
1615	NC_012943	CGG	2	6	69301	69306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796980
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1619	NC_012943	TG	3	6	69528	69533	0 %	50 %	50 %	0 %	253796980
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1622	NC_012943	GCT	2	6	69637	69642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796980
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